Pembina, Pengurus dan Pengawas
Dengan diberlakukannya Undang-Undang No. 16 Tahun 2001 tentang Yayasan, maka manajemen Yayasan Masjid Panglima Besar Soedirman terdiri atas: (1) Badan Pembina Yayasan, (2) Badan Pengurus, dan (3) Badan Pengawas.
Selanjutnya, berdasarkan akte notaris Nomor 4 tanggal 2 Oktober 2018, telah ditetapkan susunan Pembina Yayasan, Pengurus Harian, dan Pengawas Yayasan Masjid PB. Soedirman, sebagai berikut:
| Ketua Pembina | : | Letjen TNI AD. (Purn) H. KRMH. Soerjo Wirjohadipoetro |
| Sekretaris Pembina | : | Prof. Dr. Muhtosim Arief, MBA, CPM. |
| Ketua Pengurus Harian | : | Dr. H. Chalid Karim Leo, SH. M.Sc., M.Pd., MM. |
| Wakil Ketua | : | dr. Hj. Endang Titiek Surjandari, MARS. |
| Sekretaris | : | H. Suhardi, S.Pd.I. |
| Bendahara | : | Hj. Suratmi, S.Pd. |
| Pengawas | : | Dr. H. Susilo Sastro Wirejo, MM |
Ketua Majelis
Dalam melaksanakan tugas pokok dan fungsinya, Pengurus Harian Yayasan Masjid PB. Soedirman, Cijantung Jakarta Timur, dibantu oleh Ketua-Ketua Majelis (sesuai dengan Akte Notaris Nomor 4 Tahun 2018), yaitu:
| Ketua Majelis Dikdasmen | : | Drs. H. Nur Alam, MA. |
| Ketua Majelis Dikti | : | dr. Hj. Endang Titiek Surjandari, MARS. |
| Ketua Majelis Umum | : | Ir. H. Budiyono, MM. |
| Ketua Majelis Masjid | : | Drs. H. M. Haryono Hadidjaja, MM. |
| Ketua Majelis Da’wah | : | Dr. HM. Hazairin SL, MM. |
